Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rnft1Q9DCN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rnft1Q9DCN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rnft1Q9DCN7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnft1Q9DCN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnft1Q9DCN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Rnft1Q9DCN7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Rnft1Q9DCN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Rnft1Q9DCN7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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