Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufa8Q9DCJ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufa8Q9DCJ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms