Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tomm20Q9DCC8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tomm20Q9DCC8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tomm20Q9DCC8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20Q9DCC8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20Q9DCC8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms