Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx6Q9DBY5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms