Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp27a1Q9DBG1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp27a1Q9DBG1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms