Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms