Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smco2Q9DA21 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco2Q9DA21 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms