Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sgf29Q9DA08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgf29Q9DA08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms