Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA04

Tmem89, Transmembrane protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem89Q9DA04 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem89Q9DA04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem89Q9DA04 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem89Q9DA04 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem89Q9DA04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem89Q9DA04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms