Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hcfc2Q9D968 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms