Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot8Q9D8X5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms