Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rexo2Q9D8S4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rexo2Q9D8S4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rexo2Q9D8S4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms