Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D8Q6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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