Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8N1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8N1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8N1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8N1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8N1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms