Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn22Q9D7U6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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