Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rep15Q9D7T1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rep15Q9D7T1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rep15Q9D7T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rep15Q9D7T1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rep15Q9D7T1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rep15Q9D7T1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rep15Q9D7T1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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