Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms