Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PudpQ9D5U5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PudpQ9D5U5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms