Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atad1Q9D5T0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atad1Q9D5T0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms