Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc130Q9D516 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms