Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcc1Q9D4H2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms