Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc6Q9D4E6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc6Q9D4E6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms