Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syce1Q9D495 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms