Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms