Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms