Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Batf3Q9D275 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms