Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca7Q9D0M2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdca7Q9D0M2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca7Q9D0M2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms