Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zbed3Q9D0L1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed3Q9D0L1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms