Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssu72Q9CY97 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssu72Q9CY97 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms