Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nip7Q9CXK8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms