Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prdm5Q9CXE0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm5Q9CXE0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms