Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd12Q9CWU0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms