Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smurf1Q9CUN6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms