Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp13a2Q9CTG6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp13a2Q9CTG6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a2Q9CTG6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms