Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms