Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gnpda2Q9CRC9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnpda2Q9CRC9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnpda2Q9CRC9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms