Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR34

Uncharacterized protein C5orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR34 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CR34 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CR34 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CR34 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CR34 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CR34 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR34 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR34 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR34 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR34 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR34 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR34 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR34 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR34 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR34 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR34 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR34 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR34 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR34 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR34 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR34 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR34 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms