Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2Q9CQP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc2Q9CQP2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms