Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nudt21Q9CQF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nudt21Q9CQF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nudt21Q9CQF3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms