Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQC3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms