Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Txndc9Q9CQ79 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Txndc9Q9CQ79 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Txndc9Q9CQ79 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Txndc9Q9CQ79 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms