Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afb1Q9CQ70 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms