Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc198Q9CPZ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms