Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg3Q9CPX6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg3Q9CPX6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.2 ms