Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntnap2Q9CPW0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms