Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bcl11bQ99PV8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Bcl11bQ99PV8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11bQ99PV8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms