Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt23Q99PS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt23Q99PS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms