Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2a1Q99PM3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2a1Q99PM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms