Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930550L24RikQ99PA7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms