Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bco2Q99NF1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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